El SESCS forma parte de la Red Española de Agencias de Evaluación de Tecnologías Sanitarias y Prestaciones del Sistema Nacional de Salud (RedETS), así como de la European Network for Health Technology Assessment (EUnetHTA) y de la Red de Investigación en Servicios de Salud en Enfermedades Crónicas (REDISSEC), financiada por el Instituto de Salud Carlos III (ISCIII). El SESCS también es miembro del Centro de Investigaciones Biomédicas de Canarias (CIBICAN).

La Red Española de Agencias de Evaluación de Tecnologías Sanitarias y Prestaciones del Sistema Nacional de Salud está formada por las agencias o unidades de evaluación de la administración general del estado y de las comunidades autónomas, que trabajan de manera coordinada, con una metodología común y bajo el principio del reconocimiento mutuo y la cooperación. La Red Española se crea por el Consejo interterritorial del SNS en 2012, con el fin de promover la calidad, eficiencia y sostenibilidad en evaluación de tecnologías sanitarias en el SNS.

La misión de la Red es generar, difundir y facilitar la implementación de información destinada a fundamentar la toma de decisiones en el SNS, contribuyendo al incremento de la calidad, equidad, eficiencia y cohesión en el mismo.

EUnetHTA es una red de organizaciones designadas por el gobierno (de los Estados miembros de la UE, países de la UE, más países EEE y EFTA) y un gran número de agencias regionales relevantes y organizaciones sin fines de lucro que producen o contribuyen a la Evaluación de Tecnología Sanitaria en Europa.

La misión de EUnetHTA es apoyar la colaboración entre las organizaciones europeas de ETS que aporta un valor añadido a los sistemas de salud a nivel europeo, nacional y regional.

REDISSEC está construida sobre tres grandes cuestiones: el reto de gestionar el fenómeno de la cronicidad, la necesidad de disponer de más y mejor información y la obligación de incrementar la capacidad investigadora en políticas y servicios sanitarios en España.

La Red de Investigación en Servicios de Salud en Enfermedades Crónicas (REDISSEC) se compromete a desarrollar la excelencia en los campos de la investigación, el desarrollo y la innovación, con el fin de proporcionar evidencia sobre las mejores prácticas y organizaciones, con el horizonte de la mejora en los resultados de la asistencia sanitaria prestada a los pacientes crónicos en España.

El Centro de Investigaciones Biomédicas de Canarias (CIBICAN) se crea por la colaboración entre la Universidad de La Laguna (ULL), el Cabildo Insular de Tenerife y el Gobierno de Canarias, para potenciar la presencia internacional de sus grupos de investigación en Biomedicina y Ciencias de la Salud.

En CIBICAN se integran los grupos de investigación asociados a los Institutos Universitarios de ámbito biomédico y a las unidades de investigación clínica de los dos Hospitales Universitarios, incorporando los servicios generales, el equipamiento científico y el conocimiento apropiados, con objeto de acelerar los hallazgos biomédicos y su aplicación en la promoción de la salud.